El Ministerio fue creado en diciembre de 1982, al inicio de la II Legislatura, con la llegada de Felipe González al gobierno. El Ministerio fusionó los anteriores ministerios de Hacienda y de Economía y Comercio. Se mantuvo con esta denominación durante las cuatro legislaturas de Felipe González (1982-1996) y la primera de José María Aznar (1996-2000). En todo el periodo sufrió dos grandes reestructuraciones: la primera con González en noviembre de 1986 y la segunda con Aznar en agosto de 1996. El Ministerio fue suprimido en abril de 2000, al inicio del segundo mandato de Aznar (VII Legislatura), y sus competencias pasaron a los ministerios de Hacienda y de Economía.