A documentação encontrada é omissa quanto às datas de início de planeamento de um novo edifício para o Hospital da Santa Casa da Misericórdia. Tendo recebido uma comparticipação do Estado em agosto de 1939, já se encontrava em vias de conclusão em julho de 1940 e foi inaugurada em setembro de 1941. Para esta iniciativa, a Santa Casa da Misericórdia de Alijó, cujo provedor, José Rufino, era também presidente da Câmara Municipal, recebeu um total de 225.000$00 do Fundo de Desemprego.

Em agosto de 1945, a Direção dos Monumentos do Norte entregava 1 540$00 à Santa Casa da Misericórdia para obras de construção do Asilo de Velhos e Hospital de Alijó e, em outubro do mesmo ano, apresentou um projeto para uma enfermaria de crianças a construir entre o Hospital e o Asilo. Entre 1948 e 1951 esta obra de ampliação do edifício do Hospital recebeu comparticipações do Fundo de Desemprego num total de 183.690$00, ao abrigo do Decreto-Lei 21699 de 30 de setembro de 1932 e da Lei 2011 de 2 de abril de 1946.