O edifício escolar do sítio da Pena, no concelho de Loulé, foi construído como parte do Programa de Construções Escolares de 1949, integrando a IV Fase do Plano dos Centenários. Permitiu responder às necessidades educativas das crianças residentes na área definida pelo núcleo escolar de Pena (constituído pelos sítios de Arneiro da Rocha, Barrancão, Calçada, Casas Martins Eanes, Fonte Feita, Pena de Baixo, Rocha Cerrinho, Cerro das Casas e Vale do Álamo).

O processo de construção, que a Delegação para as Obras de Construção de Escolas Primárias (DOCEP) iniciou formalmente em março de 1949 com a comunicação do programa de obras à Câmara Municipal de Loulé (CML), previa a construção de um edifício com duas salas - gémeo. Contudo, o parecer municipal, baseando-se no último recenseamento escolar, que então acusava a frequência escolar de 29 crianças do sexo masculino e 29 do sexo feminino naquela área geográfica, defendia a construção de apenas uma sala que funcionasse em regime misto.

Colocada a situação a analise superior, a Direção-Geral do Ensino Primário (DGEP) confirmou a construção de um edifício escolar com apenas uma sala.

A construção do edifício foi arrematada por José Guerreiro Neto, empreiteiro adjudicatário da empreitada que incluía a construção de 10 edifícios escolares no distrito de Faro, seis dos quais no concelho de Loulé. Após o início das obras, que se tornou iminente no início de 1952, e a execução de obras complementares ainda no final desse mesmo ano, o edifício foi oficialmente inaugurado e entregue à Câmara Municipal de Loulé (CML) por Despacho ministerial em maio de 1953, marcando a conclusão da fase de construção.