A escola primária foi construída por iniciativa da Câmara Municipal da Moita, que no fim da década de 1960 encomendou o projeto ao atelier Gabinete de Projetos, da arquiteta Maria do Carmo Matos e do engenheiro Quadros Martins – também funcionários da Direção-Geral das Construções Escolares.

Na sequência de trabalho que ambos desenvolveram ao serviço do Grupo de Trabalho para Construções Escolares (Ministério da Educação Nacional), nomeadamente na concretização de um projeto piloto experimental construído em Mem Martins, a encomenda para a Baixa da Banheira integrou-se num conjunto mais alargado que incluiu a construção dos primeiros edifícios para escolas primárias de área aberta no país. Estes projetos especiais materializaram escolas previstas na Lei n.º 2107 de 1961, que promulgou as bases de execução do Plano de Construções para o Ensino Primário, com realização a cargo das autarquias. Para o caso da Baixa da Banheira estavam previstas 16 salas de aula na escola.