A escola primária foi construída por iniciativa da Câmara Municipal da Moita, que no fim da década de 1960 encomendou o projeto ao atelier Gabinete de Projetos, da arquiteta Maria do Carmo Matos e do engenheiro Victor Quadros Martins, que eram também funcionários da Junta das Construções para o Ensino Técnico e Secundário, no Ministério das Obras Públicas.

Na sequência de trabalho que ambos desenvolveram ao serviço do Grupo de Trabalho para Construções Escolares, nomeadamente a concretização de um projeto piloto experimental para uma escola construída em Mem Martins (1965), a encomenda para a Baixa da Banheira integrou-se num conjunto mais alargado que consistiu nos primeiros edifícios de escolas primárias de área aberta construídos no país. Este novo tipo de edifício escolar surgiu devido à ligação de Portugal aos planos pedagógicos da Organização para a Cooperação e Desenvolvimento Económico (OCDE), implementados a partir dos anos 60 para transformar os espaços escolares com vista a centrar o ensino no aluno.

Assim, e perante o aumento do número de alunos e à ampliação da escolaridade primária obrigatória para seis anos em 1964, pretendia-se modificar a organização interna dos espaços escolares, facilitando a circulação e a contínua adaptação através de um modelo que incluía uma sala polivalente central em torno da qual se organizavam os espaços de aulas, as zonas de entrada e os sanitários, sendo a divisão espacial feita com recurso a mobiliário especificamente desenhado. Apenas havia paredes separando a cozinha e a zona dos professores. Como forma de conter os custos, apostou-se no uso de materiais pré-fabricados e processos construtivos em série, passíveis de replicar em qualquer parte do país.

Os projetos especiais do Grupo de Trabalho para Construções Escolares materializaram as escolas previstas na Lei n.º 2107 de 1961, que promulgou as bases de execução do Plano de Construções para o Ensino Primário, com realização a cargo das autarquias. Para o caso da Baixa da Banheira estavam previstas 16 salas de aula na escola.

Em 2025, funciona como escola básica.

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